Prof Doolittle upozornil na to, že v evoluci eukaryot může
hrát velkou
roli jev, který se nazývá HGT nebo LGT, kdy je gen z jedné linii přenesen do nepříbuzné linie.
Jednobuněčná eukaryota se totiž často živí fagocytózou, což je dobrá příležitost pro HGT. Pravděpodobnost, že se gen
z fagocytované
potravy dostane do jádra a rekombinací se vymění za původní gen je velmi
malá. Jenomže
fagocytózám dochází opakovaně v životě eukaryota a po existenci linii a máme
k dispozici
velké množství času. Tento děj je navíc jednosměrný. Jakmile jednou dojde k
záměně a
ta se zafixuje v populaci, není cesty zpět. Pochopitelně, že to platí nejen pro geny z potravy, ale i ze symbiontů
(mitochondrie, plastidy). Vzpomenout na Margulisovou.
O tom, že k HGT dochází se spory nevedou. Příkladů
bylo nalezeno
mnoho. U Giardie nalezeno asi 20 genů podezřelých z HGT. Často se jedná o enzymy.