Vedle komerčních softwarových produktů pro GIS (např. ArcInfo, PCI Geomatica, GeoMedia) lze pro georeferencování naskenovaných map využít řadu volně dostupných řešení, mezi něž patří:

Georeferencer http://www.georeferencer.org/

• webová aplikace pro georeferencování map dostupných online,
• jako referenční mapu využívá OpenStreetMap, Google Maps, produkty Bing, pro území ČR pak II. a III. vojenské mapování a Záklasní mapy z produkce ČÚZK,
• výsledek georeferencování lze vizualizovat ve 3D v Google Earth nebo ve 2D s využitím afinní, polynomické nebo spline transformace,
• export georeference jako kml,
• analýza mapy s využitím nástrojů MapAnalyst,
• pro georeferencování je nutná registrace.

MapAnalyst http://mapanalyst.org/

• desktopová aplikace pro georeferencování a kartometrickou analýzu naskenovaných map,
• jako referenční mapu využívá OpenStreetMap nebo lze načíst vlastní mapu,
• možnost několika geometrických transformací (podobnostní, afinní, podobnostní s využitím metod pro hledání hrubých chyb),  
• není možné vyexportovat georeferencovanou mapu, ani textový "world file" nebo kml soubor,
• vizualizace a export do grafického formátu:
• deformace geografické sítě,
• odchylek na vlícovacích bodech,
• izočar měřítka a stočení mapy.

WorldMap WARP http://warp.worldmap.harvard.edu/

• webová aplikace pro georeferencování map umístěných lokálně na disku počítače (nikoli odkaz na url),
• jako referenční mapu využívá OpenStreetMap nebo Google Maps,
• export georeference jako geotiff, png, kml soubor nebo datová vrstva formou wms,
• možnost uložení metadat o georeferencované mapě,
• mapu lze uveřejnit nebo skrýt ostatním uživatelům,
• vizualizace výsledku nad OpenStreetMap,
• pro georeferencování je nutná registrace,
• vychází z aplikace MapRectifier.