Instrukce pro studenty a školitele doktorského studijního programu parazitologie
  1. Prezenční doktorské studium je tříleté, ve zdůvodněných případech schválených školitelem a oborovou radou může být prodlouženo na 4 roky.
  2. Prezenční studium může být přerušeno, doba přerušení se však  započítává do celkové doby studia (8 let). Nejdelší doba přerušení prezenčního studia  je celkem 5 let. Student podává písemnou žádost o přerušení studia děkanovi prostřednictvím oddělení pro doktorské studium (paní M. Čuříková).
  3. Prezenční studium může být převedeno do studia kombinovaného. Student podává písemnou žádost jako v předešlém případě.
  4. Maximální doba studia je 8 let, ale dizertační práce musí být odevzdána k obhajobě nejméně 6 měsíců před uplynutím této doby.
  5. Individuální studijní plán sestavuje školitel společně se studentem, s konzultantem (pokud je jmenován) a s vedoucím školícího pracoviště a předá jej oborové radě k projednání a schválení nejpozději 2 měsíce po zahájení školního roku. Oborová rada projednává studijní plán za přítomnosti školitele.
  6. Studijní plán  musí obsahovat seznam studijních povinností a jejich přibližné termíny, téma dizertační práce a přibližný časový plán výzkumných prací, případně doporučenou literaturu, údaje o plánovaných studijních pobytech a o účasti na výuce. Předepsaný počet studijních povinností je v rozmezí od 2 do 5. Doktorandi, kteří neabsolvovali magisterské studium v oboru parazitologie, zapisují Základy parazitologie, Buněčné a molekulární interakce mezi hostitelem a parazitem a nejméně jednu velkou specializační přednášku s praktikem (Biologie parazitických protozoí, Biologie helmintů nebo Lékařská entomologie) podle zaměření dizertace. Na rozdíl od magisterského studia se v rámci doktorského studijního programu počítá specializační přednáška a příslušné velké praktikum jako jediná studijní povinnost.
  7. Ze zapsaných studijních povinností  skládá student  dílčí odborné zkoušky. Výsledky těchto zkoušek se neznámkují, klasifikují se stupni prospěl/a - neprospěl/a. V případě neúspěchu u dílčí zkoušky má student právo na jeden opravný termín.
  8. Průběh studia hodnotí pravidelně školitel a oborová rada. Školitel podává každoročně stručnou písemnou zprávu, která obsahuje zejména tyto informace: splněné studijní povinnosti, stav výzkumných prací, prezentace výsledků (konference, semináře, publikace) a úkoly pro příští rok. Oborová rada hodnotí po prvém roce průběh studia na základě informací školitele, který se jednání OR účastní. V druhém roce se koná pohovor oborové rady se studentem a školitelem.
  9. K povinnostem doktorandů prezenčního studia patří veřejná prezentace výsledků dizertační práce na semináři parazitologického oddělení, a to v zimním semestru třetího ročníku. Mělo by jít o ucelenou přednášku (35-40 minut) s následující diskuzí, jako je tomu u seminářů zvaných hostů. Prezentace více doktorandů během jednoho semináře není žádoucí. Předpokládá se rovněž aktivní účast doktorandů na tuzemských a mezinárodních konferencích.
  10. Je třeba, aby školitelé využili svých kontaktů a podpory mezinárodních programů a umožnili svým doktorandům pracovní pobyt (3-6 měsíců) na kvalitním zahraničním pracovišti.
  11. Studijní povinnosti doktoranda jsou ukončeny státní doktorskou zkouškou. Podmínky pro vykonání zkoušky a jmenování zkušební komise jsou stanoveny Studijním a zkušebním řádem fakulty. Školitel může být členem komise, ale nesmí být předsedou. Cílem zkoušky je ověřit rozhled doktoranda v oboru parazitologie, jeho schopnost pochopit podstatu problémů a zaujmout k nim vlastní stanovisko i uplatnit poznatky z jiných oborů na parazitologickou problematiku. Zkouška je zaměřena na následující  tématické okruhy: (1) protozoologie, (2) helmintologie, (3) lékařská entomologie, (4) obecná parazitologie a navazující předměty (s ohledem na zaměření dizertační práce). Požadavky na státní doktorskou zkoušku bude oborová rada individuálně upřesňovat během čtvrtého semestru prezenčního studia, s přihlédnutím k návrhu školitele.
  12. Doktorské studium je ukončeno obhajobou dizertační práce. Předpokladem pro předložení dizertační práce je splnění studijních povinností včetně certifikované jazykové zkoušky a složení státní doktorské zkoušky. Další podmínkou jsou  minimálně dvě původní vědecké práce v oboru parazitologie, publikované nebo přijaté k publikaci v impaktovaných, mezinárodně uznávaných vědeckých časopisech. Případné výjimky (např. započtení vynikajícího rukopisu zaslaného k publikaci) podléhají schválení oborovou radou.
  13. Dizertační práce musí prokázat schopnosti doktoranda k samostatné vědecké práci. Musí obsahovat původní uveřejněné nebo k uveřejnění přijaté výsledky. Může mít formu rukopisu nebo souboru nejméně tří publikací s příbuznou tematikou, opatřeného úvodem a závěrem. Úvodní kapitola dizertace by měla ukázat hlubší vhled doktoranda do studované problematiky, což stručné úvody publikací zpravidla neumožňují. Je-li dizertace založena na výsledcích týmové spolupráce nebo publikacích, na nichž se podílí více autorů, musí být připojeno prohlášení spoluautorů nebo školitele upřesňující podíl autora dizertace na výsledcích. (Prohlášení školitele jako alternativa k prohlášení spoluautorů je odchylka od platného řádu PřF UK. Oborová rada parazitologie podala v tomto smyslu návrh senátu PřF UK na úpravu příslušného článku Studijního a zkušebního řádu).
  14. Je-li dizertace předkládána formou souboru publikací, musí obsahovat nejméně tři publikované práce, případně práce definitivně přijaté k publikaci, nikoliv rukopisy připravované nebo zaslané k publikaci (zákon a na něm postavený studijní řád nepřipouští výjimku). Doplnění povinného počtu publikací dalšími rukopisy je však přípustné.
  15. Práce připravené, zaslané nebo přijaté k tisku mohou být použity, je-li dizertace předkládána formou rukopisu, a to buď začleněné do textu ve formě kapitol nebo jako přílohy k textu dizertace.
  16. Dizertaci odevzdá doktorand ve 4 vyhotoveních na oddělení pro doktorské studium (paní Čuříková). Společně s dizertací odevzdává student i abstrakt (teze) dizertace v angličtině v počtu 22 výtisků. Teze obsahují stručný životopis, oznámení grantové podpory, jména školitele a konzultanta, jména oponentů, předsedy a členů komise pro obhajoby. Vlastní abstrakt má tyto části: úvod, cíle práce, souhrn výsledků se zmínkou o metodách (metodika může být vyčleněna do samostatné části pokud je třeba). Teze jsou zakončeny seznamem publikací doktoranda (publikace v časopisech a abstrakty odděleně). Ustálený formát abstraktů je k nahlédnutí u předsedy oborové rady. Teze rozesílá oddělení pro doktorské studium podle adresáře aktualizovaného v roce 2000. Povinností školitele je zrevidovat tento adresář a po konzultaci s předsedou komise pro obhajoby navrhnout doplnění (nebo vypuštění) adres s ohledem na zaměření práce.
  17. Pravidla pro přípravu a průběh obhajoby a pro návrh a jmenování oponentů a komise pro obhajoby jsou jasně popsána ve Studijním a zkušebním řádu PřF UK. Členem komise nebo oponentem nesmí být školitel, konzultant ani pracovník, který se na získání nebo zpracování výsledků podílel  (tj. člen týmu nebo spoluautor publikace). Je třeba zdůraznit, že oponent má dvouměsíční lhůtu na odevzdání posudku, doktorand a členové komise mají dostat posudky 4 týdny před obhajobou a jeden výtisk dizertace má být vystaven nejméně 4 týdny v oborové knihovně. Je proto třeba nenechávat vše na poslední chvíli a plánovat datum obhajoby v souladu s těmito pravidly.
  18. Za zveřejnění termínu obhajoby 4 týdny před jejím konáním zodpovídá předseda komise pro obhajoby.