2024
HelD is a Global Transcription Factor Enhancing Gene Expression in Rapidly Growing Mycobacteria
Viola Vaňková Hausnerová, Dilip Kumar, Mahmoud Shoman, Marek Schwarz, Martin Modrák, Jitka Jirát Matějčková, Silvia Neva, Jarmila Havelková, Michaela Šiková, Debora Pospíšilová, Petr Halada, Hana Šanderová, Jana Holubová, Matúš Dohál, Martin Převorovský, Ondřej Staněk,Zdeněk Knejzlík, Věra Dvořáková*, Jarmila Hnilicová*
Preprint
DOI: 10.1101/2024.11.27.625628
Expanding the CarD interaction network: CrsL is a novel transcription factor in Mycobacterium smegmatis
Mahmoud Shoman, Jitka Jirát Matějčková, Marek Schwarz, Martin Černý, Nabajyoti Borah, Viola Vaňková Hausnerová, Michaela Šiková, Hana Šanderová, Petr Halada, Martin Hubálek, Věra Dvořáková, Martin Převorovský, Jana Holubová, Ondřej Staněk, Libor Krásný, Lukáš Žídek, Jarmila Hnilicová*
Preprint
DOI: 10.1101/2024.12.02.626298
RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and the primary sigma factor in bacteria
Viola Vaňková Hausnerová, Mahmoud Shoman, Dilip Kumar, Marek Schwarz, Martin Modrák, Jitka Jirát Matějčková, Eliška Mikesková, Silvia Neva, Anna Herrmannová, Michaela Šiková, Petr Halada, Iva Novotná, Petr Pajer, Leoš Shivaya Valášek, Martin Převorovský, Libor Krásný, Jarmila Hnilicová*
Published: 2024 in Nucleic Acids Res
DOI: 10.1093/nar/gkae081
High rate of macrolide resistance and closely genetically related Mycobacterium abscessus complex strains identified among both cystic fibrosis and non-cystic fibrosis patients within two countries
Matúš Dohál*, Věra Dvořáková, Michaela Hromádková, Martina Pinková, Jana Amlerová, Marek Schwarz, Andrea Spitaleri, Federico di Marco, Jarmila Hnilicová, Eduard Gondáš, Michael E Rasmussen, Igor Porvazník, Ivan Solovič, Daniela M Cirillo, Juraj Mokrý
Published: 2024 in Microbiol Spectr
DOI: 10.1128/spectrum.01056-24
MoaB2, a newly identified transcription factor, binds to σA in Mycobacterium smegmatis
Barbora Brezovská, Subhash Narasimhan, Michaela Šiková, Hana Šanderová, Tomáš Kovaľ, Nabajyoti Borah, Mahmoud Shoman, Debora Pospíšilová, Viola Vaňková Hausnerová, Dávid Tužinčin, Martin Černý, Jan Komárek, Martina Janoušková, Milada Kambová, Petr Halada, Alena Křenková, Martin Hubálek, Mária Trundová, Jan Dohnálek, Jarmila Hnilicová*, Lukáš Žídek*, Libor Krásný*
Published: 2024 in J Bacteriol
DOI: 10.1128/jb.00066-24
up to 2023 – selected publications
Ms1 RNA Interacts With the RNA Polymerase Core in Streptomyces coelicolor and Was Identified in Majority of Actinobacteria Using a Linguistic Gene Synteny Search
Viola Vaňková Hausnerová, Olga Marvalová, Michaela Šiková, Mahmoud Shoman, Jarmila Havelková, Milada Kambová, Martina Janoušková, Dilip Kumar, Petr Halada, Marek Schwarz, Libor Krásný, Jarmila Hnilicová*, Josef Pánek*
Published: 2022 in Front Microbiol
DOI: 10.3389/fmicb.2022.848536
Ms1 RNA increases the amount of RNA polymerase in Mycobacterium smegmatis
Michaela Šiková, Martina Janoušková, Olga Ramaniuk, Petra Páleníková, Jiří Pospíšil, Pavel Bartl, Agnieszka Suder, Petr Pajer, Pavla Kubičková, Ota Pavliš, Miluše Hradilová, Dragana Vítovská, Hana Šanderová, Martin Převorovský, Jarmila Hnilicová*, Libor Krásný*
Published: 2019 in Mol Microbiol
DOI: 10.1111/mmi.14159
Ms1, a novel sRNA interacting with the RNA polymerase core in mycobacteria
Jarmila Hnilicová, Jitka Jirát Matějčková, Michaela Šiková, Jiří Pospíšil, Petr Halada, Josef Pánek, Libor Krásný*
Published: 2014 in Nucleic Acids Res
DOI: 10.1093/nar/gku793